Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CABS1Q96KC9 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CABS1Q96KC9 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms