Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms