Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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