Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms