Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTF1AQ7RTS3 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms