Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms