Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP28Q4G0W2 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms