Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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