Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNB1Q14721 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms