Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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CUL1Q13616 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CUL1Q13616 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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