Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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STRN3Q13033 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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STRN3Q13033 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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STRN3Q13033 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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STRN3Q13033 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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STRN3Q13033 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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STRN3Q13033 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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STRN3Q13033 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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