Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RAB40BQ12829 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RAB40BQ12829 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RAB40BQ12829 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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RAB40BQ12829 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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RAB40BQ12829 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB40BQ12829 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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