Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSME1Q06323 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms