Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms