Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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