Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FNTAP49354 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FNTAP49354 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FNTAP49354 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms