Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NESP48681 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NESP48681 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NESP48681 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NESP48681 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NESP48681 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NESP48681 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NESP48681 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NESP48681 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NESP48681 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NESP48681 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NESP48681 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NESP48681 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NESP48681 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NESP48681 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NESP48681 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NESP48681 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NESP48681 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms