Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms