Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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HOXD12P35452 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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HOXD12P35452 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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