Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms