Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMP3P12645 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMP3P12645 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms