Protein–RNA interactions for Protein: P0C7U9

FAM87A, Protein FAM87A, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM87AP0C7U9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM87AP0C7U9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms