Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
F13BP05160 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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F13BP05160 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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F13BP05160 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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F13BP05160 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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F13BP05160 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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F13BP05160 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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F13BP05160 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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F13BP05160 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
F13BP05160 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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