Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms