Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms