Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PMF1-BGLAPU3KQ54 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms