Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX11Q9Y5W9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX11Q9Y5W9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX11Q9Y5W9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms