Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4M8

LINC00588, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00588, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00588Q9Y4M8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00588Q9Y4M8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00588Q9Y4M8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms