Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC44.19■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.67
DCAF1Q9Y4B6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC44.19■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC44.15■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC44.14■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
DCAF1Q9Y4B6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC44.1■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC44.08■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC44.05■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
DCAF1Q9Y4B6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms