Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BP1Q9Y3L3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BP1Q9Y3L3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms