Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2D4Q9Y2X8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms