Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR1DQ9Y2S0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1DQ9Y2S0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms