Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP1Q9UPQ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGAP1Q9UPQ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP1Q9UPQ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms