Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD4Q9ULV1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FZD4Q9ULV1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms