Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL8

SHROOM4, Protein Shroom4, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM4Q9ULL8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
SHROOM4Q9ULL8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC43.39■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
SHROOM4Q9ULL8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC43.38■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC43.37■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC43.36■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.32■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
SHROOM4Q9ULL8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
SHROOM4Q9ULL8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
SHROOM4Q9ULL8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms