Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PADI1Q9ULC6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms