Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SARDHQ9UL12 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARDHQ9UL12 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARDHQ9UL12 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARDHQ9UL12 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARDHQ9UL12 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARDHQ9UL12 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARDHQ9UL12 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SARDHQ9UL12 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARDHQ9UL12 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SARDHQ9UL12 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms