Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PARP4Q9UKK3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PARP4Q9UKK3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PARP4Q9UKK3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms