Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPN3Q9UHW5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms