Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP25Q9UHP3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP25Q9UHP3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms