Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK1NQ9UHG2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK1NQ9UHG2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK1NQ9UHG2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK1NQ9UHG2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK1NQ9UHG2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK1NQ9UHG2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK1NQ9UHG2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK1NQ9UHG2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK1NQ9UHG2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK1NQ9UHG2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCSK1NQ9UHG2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCSK1NQ9UHG2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCSK1NQ9UHG2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCSK1NQ9UHG2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCSK1NQ9UHG2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK1NQ9UHG2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms