Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRPS1Q9UHF7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms