Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASIC3Q9UHC3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASIC3Q9UHC3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms