Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VTI1BQ9UEU0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
VTI1BQ9UEU0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1BQ9UEU0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms