Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM8A1Q9UBU6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms