Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGC1AQ9UBK2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPARGC1AQ9UBK2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms