Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDH10Q9P2E7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDH10Q9P2E7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms