Protein–RNA interactions for Protein: Q9P278

FNIP2, Folliculin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP2Q9P278 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNIP2Q9P278 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNIP2Q9P278 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNIP2Q9P278 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms