Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCN3Q9P1Z3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HCN3Q9P1Z3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms