Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SENP1Q9P0U3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SENP1Q9P0U3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SENP1Q9P0U3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms